Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp3Q7TNH6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nphp3Q7TNH6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms