Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gga2Q6P5E6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gga2Q6P5E6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gga2Q6P5E6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gga2Q6P5E6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms