Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CochQ62507 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CochQ62507 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CochQ62507 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CochQ62507 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CochQ62507 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CochQ62507 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CochQ62507 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CochQ62507 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CochQ62507 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CochQ62507 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CochQ62507 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CochQ62507 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CochQ62507 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CochQ62507 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CochQ62507 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CochQ62507 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CochQ62507 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CochQ62507 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CochQ62507 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CochQ62507 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CochQ62507 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CochQ62507 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CochQ62507 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CochQ62507 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CochQ62507 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CochQ62507 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CochQ62507 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CochQ62507 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CochQ62507 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CochQ62507 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CochQ62507 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CochQ62507 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CochQ62507 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CochQ62507 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CochQ62507 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CochQ62507 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CochQ62507 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CochQ62507 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CochQ62507 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CochQ62507 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CochQ62507 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CochQ62507 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CochQ62507 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CochQ62507 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CochQ62507 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CochQ62507 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CochQ62507 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CochQ62507 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CochQ62507 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CochQ62507 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CochQ62507 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CochQ62507 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CochQ62507 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CochQ62507 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CochQ62507 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CochQ62507 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CochQ62507 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CochQ62507 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CochQ62507 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CochQ62507 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CochQ62507 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CochQ62507 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CochQ62507 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CochQ62507 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CochQ62507 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CochQ62507 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CochQ62507 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CochQ62507 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CochQ62507 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CochQ62507 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CochQ62507 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CochQ62507 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CochQ62507 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CochQ62507 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CochQ62507 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CochQ62507 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CochQ62507 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CochQ62507 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CochQ62507 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CochQ62507 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CochQ62507 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CochQ62507 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CochQ62507 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CochQ62507 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CochQ62507 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CochQ62507 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CochQ62507 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CochQ62507 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CochQ62507 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CochQ62507 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CochQ62507 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CochQ62507 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CochQ62507 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CochQ62507 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CochQ62507 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CochQ62507 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CochQ62507 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CochQ62507 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CochQ62507 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms