Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ItgaeQ60677 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ItgaeQ60677 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ItgaeQ60677 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms