Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trafd1Q3UDK1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trafd1Q3UDK1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trafd1Q3UDK1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trafd1Q3UDK1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms