Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a5Q3TYU2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a5Q3TYU2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a5Q3TYU2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a5Q3TYU2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms