Protein–RNA interactions for Protein: Q3E827

LSO1, Protein LSO1, yeastyeast

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSO1Q3E827 IES2YNL215W 963 nt7.23□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 DFR1YOR236W 636 nt7.23□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 ATF1YOR377W 1578 nt7.23□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 MRN1YPL184C 1839 nt7.22□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 KTR4YBR199W 1395 nt7.22□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 YKR015CYKR015C 1707 nt7.22□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 SRV2YNL138W 1581 nt7.22□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 HIM1YDR317W 1245 nt7.22□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 YLR118CYLR118C 684 nt7.22□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 MET22YOL064C 1074 nt7.22□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 GIP2YER054C 1647 nt7.22□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 ARG7YMR062C 1326 nt7.22□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 CLP1YOR250C 1338 nt7.22□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 ATG7YHR171W 1893 nt7.21□□□□□ -1.25
LSO1Q3E827 LRO1YNR008W 1986 nt7.21□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 INO2YDR123C 915 nt7.21□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 KSS1YGR040W 1107 nt7.21□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 DAL2YIR029W 1032 nt7.21□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 CDC11YJR076C 1248 nt7.21□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 SFK1YKL051W 1062 nt7.21□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 CSM3YMR048W 954 nt7.21□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 ARG8YOL140W 1272 nt7.21□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 IPL1YPL209C 1104 nt7.21□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 NOG2YNR053C 1461 nt7.21□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 DIP5YPL265W 1827 nt7.2□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 BRL1YHR036W 1416 nt7.2□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 SET4YJL105W 1683 nt7.2□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 YDL023CYDL023C 321 nt7.2□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 PEX19YDL065C 1029 nt7.2□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 FZF1YGL254W 900 nt7.2□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 YGL262WYGL262W 528 nt7.2□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 NMA2YGR010W 1188 nt7.2□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 CTK2YJL006C 972 nt7.2□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 HRT3YLR097C 1035 nt7.2□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 YLR280CYLR280C 351 nt7.2□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt7.2□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 POP4YBR257W 840 nt7.2□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 RIT1YMR283C 1542 nt7.2□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 YHL012WYHL012W 1482 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 FKH1YIL131C 1455 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 ORM2YLR350W 651 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 RNA170RNA170 169 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 YNL143CYNL143C 393 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 YBR232CYBR232C 360 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 RRT2YBR246W 1164 nt7.19□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 YLR345WYLR345W 1530 nt7.18□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 PPH22YDL188C 1134 nt7.18□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 GRH1YDR517W 1119 nt7.18□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 Q0142Q0142 177 nt7.18□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.18□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 CPR6YLR216C 1116 nt7.18□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 PSH1YOL054W 1221 nt7.18□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 ECM8YBR076W 1065 nt7.18□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 RMD8YFR048W 1989 nt7.18□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 TKL2YBR117C 2046 nt7.18□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 OCH1YGL038C 1443 nt7.18□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 TEC1YBR083W 1461 nt7.17□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 GUF1YLR289W 1938 nt7.17□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 TGL1YKL140W 1647 nt7.17□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 ERG20YJL167W 1059 nt7.17□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 MRT4YKL009W 711 nt7.17□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 VPS20YMR077C 666 nt7.17□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 MCT1YOR221C 1083 nt7.17□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 YPL068CYPL068C 882 nt7.17□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 TOS1YBR162C 1368 nt7.17□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 YBR284WYBR284W 2394 nt7.17□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 TFG1YGR186W 2208 nt7.16□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 ERO1YML130C 1692 nt7.16□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 MAL31YBR298C 1845 nt7.16□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt7.16□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 ERG25YGR060W 930 nt7.16□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt7.16□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 RUF5-1RUF5-1 710 nt7.16□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 RUF5-2RUF5-2 710 nt7.16□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 RSC9YML127W 1746 nt7.15□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 OCA4YCR095C 1089 nt7.15□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 PUP3YER094C 618 nt7.15□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 HGH1YGR187C 1185 nt7.15□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 CIR1YGR207C 786 nt7.15□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 RSM26YJR101W 801 nt7.15□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 YKL031WYKL031W 414 nt7.15□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 YAL066WYAL066W 309 nt7.15□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 YMR166CYMR166C 1107 nt7.15□□□□□ -1.26
LSO1Q3E827 PRP19YLL036C 1512 nt7.15□□□□□ -1.27
LSO1Q3E827 HXT2YMR011W 1626 nt7.15□□□□□ -1.27
LSO1Q3E827 YCR100CYCR100C 951 nt7.14□□□□□ -1.27
LSO1Q3E827 YDR282CYDR282C 1245 nt7.14□□□□□ -1.27
LSO1Q3E827 SNM1YDR478W 597 nt7.14□□□□□ -1.27
LSO1Q3E827 MAD3YJL013C 1548 nt7.14□□□□□ -1.27
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