Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 YBR144CYBR144C 315 nt7.56□□□□□ -1.2
SLM3Q12093 RFC1YOR217W 2586 nt7.56□□□□□ -1.2
SLM3Q12093 YHM2YMR241W 945 nt7.55□□□□□ -1.2
SLM3Q12093 ERI1YPL096C-A 207 nt7.55□□□□□ -1.2
SLM3Q12093 RPL21AYBR191W 483 nt7.55□□□□□ -1.2
SLM3Q12093 YGL235WYGL235W 537 nt7.54□□□□□ -1.2
SLM3Q12093 YLR194CYLR194C 765 nt7.54□□□□□ -1.2
SLM3Q12093 SSO1YPL232W 873 nt7.54□□□□□ -1.2
SLM3Q12093 ECM27YJR106W 2178 nt7.54□□□□□ -1.2
SLM3Q12093 GUD1YDL238C 1470 nt7.54□□□□□ -1.2
SLM3Q12093 TRR1YDR353W 960 nt7.53□□□□□ -1.2
SLM3Q12093 ERG3YLR056W 1098 nt7.53□□□□□ -1.2
SLM3Q12093 ADE13YLR359W 1449 nt7.52□□□□□ -1.2
SLM3Q12093 YMR155WYMR155W 1644 nt7.52□□□□□ -1.2
SLM3Q12093 MRPL36YBR122C 534 nt7.52□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 YLR173WYLR173W 1827 nt7.52□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 YDL114WYDL114W 927 nt7.51□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 OPI8YKR035C 642 nt7.51□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 SKG1YKR100C 1068 nt7.51□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 COX5AYNL052W 462 nt7.51□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 GLN1YPR035W 1113 nt7.51□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 PGM1YKL127W 1713 nt7.49□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 GIR2YDR152W 798 nt7.49□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 RPS9AYPL081W 594 nt7.49□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 SES1YDR023W 1389 nt7.48□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 BSC4YNL269W 396 nt7.48□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 YCL041CYCL041C 495 nt7.48□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 NTE1YML059C 5040 nt7.47□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 HSM3YBR272C 1443 nt7.47□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 YLR283WYLR283W 945 nt7.47□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 KIN1YDR122W 3195 nt7.47□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 EFM1YHL039W 1758 nt7.46□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 YGL036WYGL036W 2730 nt7.46□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 KKQ8YKL168C 2175 nt7.46□□□□□ -1.21
SLM3Q12093 YRA1YDR381W 681 nt7.46□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 COA1YIL157C 594 nt7.46□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 SHM1YBR263W 1473 nt7.46□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 SEC23YPR181C 2307 nt7.46□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 RTG2YGL252C 1767 nt7.46□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 YML133CYML133C 4125 nt7.46□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 MCM3YEL032W 2916 nt7.45□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 APE3YBR286W 1614 nt7.45□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 YCL065WYCL065W 369 nt7.45□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 YDR154CYDR154C 351 nt7.45□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 SUP19tS(UGA)E 82 nt7.45□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 SUP17tS(UGA)I 82 nt7.45□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 SUP16tS(UGA)P 82 nt7.45□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 SPT3YDR392W 1014 nt7.44□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt7.44□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 AMD1YML035C 2433 nt7.44□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 RRP45YDR280W 918 nt7.43□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 PRM10YJL108C 1152 nt7.43□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 SRF1YDL133W 1314 nt7.43□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 ORC5YNL261W 1440 nt7.43□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 GYP8YFL027C 1494 nt7.43□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 ILV2YMR108W 2064 nt7.42□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt7.42□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt7.42□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 DJP1YIR004W 1299 nt7.42□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 GAA1YLR088W 1845 nt7.42□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 YDR109CYDR109C 2148 nt7.42□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 QNS1YHR074W 2145 nt7.41□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 GLE1YDL207W 1617 nt7.41□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 RPT3YDR394W 1287 nt7.4□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 DMA1YHR115C 1251 nt7.4□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 SFC1YJR095W 969 nt7.4□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 YNL190WYNL190W 615 nt7.4□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 YJR015WYJR015W 1533 nt7.4□□□□□ -1.22
SLM3Q12093 YPR204WYPR204W 3099 nt7.4□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 YAP1801YHR161C 1914 nt7.39□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 DTR1YBR180W 1719 nt7.39□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 YLR118CYLR118C 684 nt7.39□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 DAL82YNL314W 768 nt7.39□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 NUD1YOR373W 2556 nt7.39□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 VRP1YLR337C 2454 nt7.39□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 TIM54YJL054W 1437 nt7.38□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 CRP1YHR146W 1398 nt7.38□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 TEP1YNL128W 1305 nt7.38□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt7.38□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.38□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 VPS61YDR136C 573 nt7.37□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 YEA6YEL006W 1008 nt7.37□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 YGR176WYGR176W 348 nt7.37□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 PGU1YJR153W 1086 nt7.37□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 YKL151CYKL151C 1014 nt7.37□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 YNL019CYNL019C 855 nt7.37□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 YNL033WYNL033W 855 nt7.37□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 GIT1YCR098C 1557 nt7.37□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 LPD1YFL018C 1500 nt7.37□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 SOG2YOR353C 2376 nt7.37□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 PRO3YER023W 861 nt7.36□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 APS3YJL024C 585 nt7.36□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 YGR182CYGR182C 354 nt7.35□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 HSX1tR(CCU)J 72 nt7.35□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 YBR124WYBR124W 360 nt7.35□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 FRS2YFL022C 1512 nt7.34□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 YDR278CYDR278C 318 nt7.34□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 HSP12YFL014W 330 nt7.34□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 YOR342CYOR342C 960 nt7.34□□□□□ -1.23
SLM3Q12093 PRP46YPL151C 1356 nt7.33□□□□□ -1.24
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