Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NrepQ07475 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NrepQ07475 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NrepQ07475 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NrepQ07475 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NrepQ07475 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NrepQ07475 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NrepQ07475 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NrepQ07475 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NrepQ07475 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NrepQ07475 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrepQ07475 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrepQ07475 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrepQ07475 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrepQ07475 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NrepQ07475 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrepQ07475 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NrepQ07475 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrepQ07475 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NrepQ07475 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrepQ07475 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrepQ07475 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrepQ07475 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrepQ07475 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NrepQ07475 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NrepQ07475 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NrepQ07475 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NrepQ07475 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NrepQ07475 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NrepQ07475 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NrepQ07475 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrepQ07475 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrepQ07475 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrepQ07475 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrepQ07475 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrepQ07475 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NrepQ07475 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrepQ07475 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrepQ07475 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrepQ07475 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NrepQ07475 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NrepQ07475 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrepQ07475 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrepQ07475 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NrepQ07475 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NrepQ07475 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrepQ07475 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NrepQ07475 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrepQ07475 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrepQ07475 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NrepQ07475 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrepQ07475 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrepQ07475 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrepQ07475 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrepQ07475 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrepQ07475 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NrepQ07475 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrepQ07475 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms