Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cxcr5Q04683 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cxcr5Q04683 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cxcr5Q04683 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms