Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gjc1P28229 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjc1P28229 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjc1P28229 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms