Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata3P23772 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata3P23772 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata3P23772 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gata3P23772 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata3P23772 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata3P23772 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata3P23772 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms