Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SagP20443 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SagP20443 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SagP20443 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SagP20443 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SagP20443 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SagP20443 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SagP20443 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SagP20443 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SagP20443 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SagP20443 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SagP20443 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SagP20443 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SagP20443 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SagP20443 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SagP20443 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SagP20443 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SagP20443 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SagP20443 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SagP20443 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SagP20443 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SagP20443 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SagP20443 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SagP20443 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SagP20443 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SagP20443 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SagP20443 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SagP20443 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SagP20443 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SagP20443 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SagP20443 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SagP20443 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SagP20443 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SagP20443 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SagP20443 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SagP20443 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SagP20443 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SagP20443 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SagP20443 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SagP20443 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SagP20443 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SagP20443 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SagP20443 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SagP20443 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SagP20443 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SagP20443 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SagP20443 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SagP20443 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SagP20443 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SagP20443 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SagP20443 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SagP20443 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SagP20443 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SagP20443 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SagP20443 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SagP20443 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SagP20443 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SagP20443 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SagP20443 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SagP20443 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SagP20443 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SagP20443 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SagP20443 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SagP20443 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SagP20443 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SagP20443 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SagP20443 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SagP20443 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SagP20443 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SagP20443 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SagP20443 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SagP20443 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SagP20443 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SagP20443 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SagP20443 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SagP20443 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SagP20443 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SagP20443 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SagP20443 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SagP20443 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SagP20443 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SagP20443 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SagP20443 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SagP20443 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SagP20443 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SagP20443 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SagP20443 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SagP20443 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SagP20443 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SagP20443 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SagP20443 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SagP20443 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SagP20443 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SagP20443 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SagP20443 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SagP20443 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SagP20443 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SagP20443 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SagP20443 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SagP20443 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.7 ms