Protein–RNA interactions for Protein: P08882

Gzmc, Granzyme C, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmcP08882 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GzmcP08882 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GzmcP08882 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GzmcP08882 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GzmcP08882 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GzmcP08882 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GzmcP08882 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GzmcP08882 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GzmcP08882 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GzmcP08882 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GzmcP08882 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GzmcP08882 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GzmcP08882 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GzmcP08882 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GzmcP08882 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
GzmcP08882 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GzmcP08882 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GzmcP08882 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GzmcP08882 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GzmcP08882 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GzmcP08882 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GzmcP08882 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GzmcP08882 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GzmcP08882 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GzmcP08882 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GzmcP08882 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GzmcP08882 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GzmcP08882 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GzmcP08882 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GzmcP08882 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GzmcP08882 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms