Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XlrP05531 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XlrP05531 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XlrP05531 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XlrP05531 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XlrP05531 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XlrP05531 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XlrP05531 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XlrP05531 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XlrP05531 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XlrP05531 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XlrP05531 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XlrP05531 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XlrP05531 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XlrP05531 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XlrP05531 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XlrP05531 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XlrP05531 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XlrP05531 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XlrP05531 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XlrP05531 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XlrP05531 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XlrP05531 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XlrP05531 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XlrP05531 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XlrP05531 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XlrP05531 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XlrP05531 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XlrP05531 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XlrP05531 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XlrP05531 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XlrP05531 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XlrP05531 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XlrP05531 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XlrP05531 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XlrP05531 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XlrP05531 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XlrP05531 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XlrP05531 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XlrP05531 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XlrP05531 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XlrP05531 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XlrP05531 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XlrP05531 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XlrP05531 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XlrP05531 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XlrP05531 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XlrP05531 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XlrP05531 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XlrP05531 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XlrP05531 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XlrP05531 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23■■□□□ 1.27
XlrP05531 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XlrP05531 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XlrP05531 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XlrP05531 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XlrP05531 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XlrP05531 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XlrP05531 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XlrP05531 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XlrP05531 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XlrP05531 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XlrP05531 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XlrP05531 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XlrP05531 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XlrP05531 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XlrP05531 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XlrP05531 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XlrP05531 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XlrP05531 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XlrP05531 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XlrP05531 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XlrP05531 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XlrP05531 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XlrP05531 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XlrP05531 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XlrP05531 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XlrP05531 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XlrP05531 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XlrP05531 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XlrP05531 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XlrP05531 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XlrP05531 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XlrP05531 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XlrP05531 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XlrP05531 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XlrP05531 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XlrP05531 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XlrP05531 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XlrP05531 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XlrP05531 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XlrP05531 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XlrP05531 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XlrP05531 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XlrP05531 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XlrP05531 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XlrP05531 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XlrP05531 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XlrP05531 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XlrP05531 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms