Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r58G3X9U3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r58G3X9U3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r58G3X9U3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms