Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930579F01RikE9Q3L6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms