Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm2012B1B0R1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2012B1B0R1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2012B1B0R1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms