Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM2AQ9Y2K7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms