Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTLNQ9NXG0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTLNQ9NXG0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms