Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASF1BQ9NVP2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms