Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2TQ9NPD8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2TQ9NPD8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms