Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4CQ9C0C4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms