Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MVB12AQ96EY5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms