Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ift88Q61371 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift88Q61371 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ift88Q61371 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
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