Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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