Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms