Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GNPDA1P46926 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms