Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB1P20618 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms