Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HPS5Q9UPZ3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HPS5Q9UPZ3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms