Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FANCD2Q9BXW9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FANCD2Q9BXW9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FANCD2Q9BXW9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FANCD2Q9BXW9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FANCD2Q9BXW9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FANCD2Q9BXW9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms