Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SENP8Q96LD8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms