Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COG3Q96JB2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms