Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSTM1Q6UX27 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSTM1Q6UX27 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms