Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx13Q6PHS6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx13Q6PHS6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms