Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms