Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC27Q2M243 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms