Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP6Q16828 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP6Q16828 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms