Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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