Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNB2Q08289 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms