Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPN12Q05209 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms