Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms