Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTCQ00610 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms