Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP4P57723 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms