Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGDP52209 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGDP52209 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms