Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASQ1P31415 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms