Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP3Q9Y3E7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms