Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MIS18AQ9NYP9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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MIS18AQ9NYP9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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MIS18AQ9NYP9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
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MIS18AQ9NYP9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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MIS18AQ9NYP9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIS18AQ9NYP9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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