Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms