Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms